قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات

من موسوعة العلوم العربية
اذهب إلى التنقل اذهب إلى البحث
SCOP
قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات
ملف:Scop logo small.gif
عنوان الموقع http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/
نوع الموقع قاعدة بيانات عن مجالات البروتينات
تاريخ الإطلاق 1994
الوضع الحالي الإصدار الحالي 1.75 (حزيران 2009)

قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات (بالإنجليزية: Structural Classification of Proteins database) (مختصرها سكوب أو SCOP) هو دليل تصنيفي إلى حد كبير في المجالات الهيكلية للبروتين على أساس تشابه هياكلها وتسلسل الأحماض الأمينية. الدافع وراء هذا التصنيف هو تحديد العلاقة التطورية بين البروتينات. توضع البروتينات التي تتصف بأشكال متشابهة ولكنها تتصف بوجود القليل من التشابه في التسلسل أو الوظيفة في عوائل رئيسية مختلفة، لكن توضع فرضية أن السلف المشترك بعيد جداً، كما توضع البروتينات التي لها نفس الشكل وبعض التشابه في التسلسل أو الوظيفة في الأسر ذاتها، ويفترض أن يكون لها سلف مشترك أوثق.

قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات يمكن الوصول إليها بحرية على شبكة الانترنت. أنشئت قاعدة البيانات في عام 1994.[1] يصونها أليكسي مورزين وزملاؤه في مختبر علم الأحياء الجزيئي ‏(en) في كامبريدج في إنجلترا.[2][3][4]

في آب 2013، كان الإصدار الحالي من قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات هو 1.75 (والذي صدر حزيران 2009). نسخة من الإصدار التالي من قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات، وهو ما يسمى بري-سكوب (pre-SCOP)، يمكن الوصول إليها من الصفحة الرئيسية لقاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات.

بري-سكوب (pre-SCOP) يقصد بها نظرة عامة أو معاينة لقاعدة البيانات وأصلها من كلمة (preview) الإنجليزية.

المصادر

  1. PMID 18000004 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by handقاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات
  2. PMID 9847194 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by handقاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات
  3. PMID 10592240 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by handقاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات
  4. PMID 14681400 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by handقاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات